中国科学技术大学公共实验中心始建于2000年，是由教育部“985”工程和“211”工程专项经费、科学院专项经费及我校自筹资金共同投入建设而成，是学校建设世界一流研究型大学的创新举措，也是学校一流大学建设重点支持项目。公共实验中心以“集中投入、统一管理、开放公用、资源共享”为建设原则，以建立条件优良、功能配套、管理规范、先进高效的优质资源和共享机制为建设目标，为培养创新人才和开展高水平科学研究工作提供技术支撑，为社会经济建设提供技术保障。目前无论在实验室管理、大型仪器设备的先进性、技术人员水平、支撑科研的能力均名列全国高校分析测试平台的前列，也是学校高水平建设成就亮点之一。

2009年我校公共实验中心加入“中国科学院合肥战略能源与物质科学大型仪器区域中心”。 “合肥战略能源与物质科学大型仪器区域中心”是中科院首批成立的9个大型仪器区域中心之一，由我校和中科院合肥物质科学研究院联合组建，我校是该服务平台的骨干成员。

公共实验中心包含了理化科学实验中心、生命科学实验中心、工程与材料科学实验中心、信息科学实验中心、超级计算中心和微纳研究与制造中心等六个公共实验分中心。目前，中心在职人员136人，实验室面积16700㎡，50万元以上分析测试、表征、制备等设备275台/套，价值约8.2亿元。仪器设备性能先进、状态良好。